Formal:
* সে কোথায় থাকে? (Se kôthao thake?)
Informal:
* ও কোথায় থাকে? (O kôthao thake?)
* সে কোথায় বাস করে? (Se kôthao bas kore?)
* ও কোথায় বাস করে? (O kôthao bas kore?)
More specific:
* সে কোন শহরে থাকে? (Se kon shohore thake?) - Where does he live in which city?
* সে কোন গ্রামে থাকে? (Se kon graame thake?) - Where does he live in which village?
Choose the translation that best fits the context and your level of formality.